מנכ"ל משרד הבריאות הנחה את בתי החולים לפעול על-פי הנחיות נצורות ולרדת לתת-קרקע. ההנחיה, שניתנה בתום הערכת מצב, כוללת גיוס כוח אדם למעבר מהיר לחירום לצד גיוס מקביל של צה"ל לסיוע. בתי החולים הונחו להיערך לשחרור מטופלים. מרפאות קופות החולים וטיפות החלב יפעלו רק במבנים בעלי מרחב מוגן או בסמיכות אליו.