בגלי צה"ל נחשפו הקלטות בהן נשמע הרב עובדיה יוסף קורא לאלי ישי "יושב-ראש נאמן". להקלטה מ-2008 התייחס יעקב ששון, נכדו של הרב: "בזמן שכל עם ישראל היה עצוב, אנשים שנחשבו לאנשים קרובים, היה להם את הראש והמחשבה להיכנס בשביל להקליט ולומר איזה מילה כדי לקבל מילה בחזרה. הרב אהב את אלי ישי למרות שבשנים האחרונות הנושא של לסמוך עליו לא היה כזה מושלם".