''
נקודה
תל אביב
שמיים בהירים
24°
ירושלים 20°
חיפה 25°
באר שבע 23°
אילת 26°
מדורים
שימושי PLUS

חוקרי SARS בסין משתמשים בטכנולוגיות של SGI למחקר גנומי ופיתוח תרופות למחלה

החוקרים משתמשים בתחנות העבודה הגרפיות של SGI לבנות מודלים תלת-ממדיים של מבני חלבונים אלה וכדי לנתח את תוצאות המיפוי הוירטואלי בזמן אמת; עד-כה לא נמצאה תרופה לריפוי המחלה

הדר פרבר
י' סיון התשס"ג

שני מוסדות מחקר בסין מנהלים בימים אלה מחקר מהפכני המתמקד במחלת ה-SARS תוך שימוש בשרתים של SGI (סיליקון גרפיקס).

מכון הגנום בבייג'ינג (BGI) מנסה לזהות את הבסיס הגנומי של ה-SARS על כל גווניו, בעוד מכון Materia Medica - SIMM בשנגחאי, מנסה לפתח תרכיב חיסון יעיל.

נכון להיום, עדיין לא קיימת בדיקה מהירה במונחי זמן, המסוגלת לאבחן את המחלה החדשה בזמן שניתן עוד לטפל בה, מה גם שלא ידוע עדיין על טיפול או על מרפא יעיל למחלה.

ב-SGI מסבירים, כי חוקרי SIMM כבר יצרו מודלים תלת-ממדיים של מספר מבנים חלבוניים של SARS וביצעו מספר ניפויים וירטואליים, תוך ניצול מספר בסיסי נתונים של תרכובות תרופות פוטנציאליות. התשתית הטכנולוגית המשמשת מחקר זה, כוללת: מחשב על 3800 ®Origin ®SGI בעל 64 מעבדים, שרת 3200 ®Origin ®SGI בעל ארבעה מעבדים ו-15 תחנות עבודה של SGI המשמשות לבניית המודלים ולהצגה וירטואלית של כמה מיליוני מבנים, במטרה לפתח תרכובת חדשה שתילחם בווירוס ה-SARS.

שרת ה-®Origin מטפל במשימות מיפוי וירטואלי מרובות נתונים ובאחסון של בסיסי נתונים כימיים ענקיים, בעזרת טכנולוגית ™NUMAflex, הזיכרון המשותף ויכולת שדרוג שמאפשר ממשק יישומי ®OpenGL של משפחת שרתי ה-Origin. כדי לתת מענה לאפיון המוטציה של וירוס ה-SARS, נעשה שימוש במחשב העל של SGI למיפוי אזורי מוטציה וליצירת מערכי נתונים המגדירים במדויק את מבנה החלבונים שעברו מוטציה.

החוקרים משתמשים בתחנות העבודה הגרפיות של SGI כדי לבנות מודלים תלת-ממדיים של מבני חלבונים אלה וכדי לנתח את תוצאות המיפוי הוירטואלי בזמן אמת.

BGI, מכון המחקר הגנומי הגדול ביותר באסיה-פסיפיק והשלישי בגודלו בקרב מכוני מחקר הגנום בעולם, משתמש בשני מחשבי על בעלי 32 מעבדים, מסדרת 3000 ®Origin של SGI וכן במערכת האחסון TP9100 ®SGI בעלת חמישה טרה-בייט ובמספר מערכות גרפיות ®O2 של SGI. טכנולוגיות אלו משמשות לביצוע משימות חיוניות כמו מידול הבסיס הגנומי של ה-SARS ושל רצפי חלבונים הקשורים ל-SARS, לצד מגוון יישומים חישוביים אינטנסיביים.

אודות SGI (סיליקון גרפיקס)

SGI (סיליקון גרפיקס), היא ספקית עולמית מובילה של פתרונות למחשוב וויזואליזציה עתירי ביצועים ופתרונות אחסון לניהול סביבות מידע תובעניות.

חזונה של SGI מתמקד באספקת טכנולוגיה המאפשרת להשיג את פריצות הדרך המדעיות והיצירתיות המשמעותיות ביותר של המאה ה-21. בין אם מדובר בהדמיה של ניתוחי לב, גילוי נפט ביעילות רבה יותר, חקר האקלים שעל פני כדור הארץ או מעבר משידור אנלוגי לדיגיטלי. מטרתה של SGI היא לתת מענה לדור הבא של אתגרים הניצבים בפני משתמשים בתחומי המדע, התכנון והיצירה.

SGI, הנמנית על רשימת "100 החברות שכדאי לעבוד בהן של מגזין
2003Fortune, הינה בעלת סניפים ברחבי העולם ומשרדיה הראשיים ממוקמים ב-Mountain View קליפורניה. www.sgi.com

SGI ישראל הוקמה בשנת 1988 על-ידי חברת SGI העולמית כחברה בת בבעלות מלאה. החברה עוסקת בשיווק, מכירה, תמיכה ותחזוקה של שרתים, תחנות עבודה ופתרונות אחסון. בין לקוחות החברה נמנים גופים מהמובילים בארץ, בסקטור התעשיתי וההנדסי כגון: מוסדות מחקר והשכלה גבוהה, צה"ל, תעשיות ביטחוניות, וחברות בתחומי המדע, הביו-אינפורמטיקה, הרפואה והבידור.

תגובות

רגע, שקט פה מדי

דעתך חשובה - תהיו הראשונים להגיב על הכתבה