הסוכנות היהודית הקימה מטה חירום מיוחד בעקבות התפשטות שפעת החזירים במקסיקו ובמדינות נוספות. מטה החירום עוקב אחר ההתפתחויות במשבר הבריאותי העולמי ונערך למתן מענה מיידי למאות שליחי ועובדי הסוכנות היהודית ברחבי העולם.